PolitiFact gehört dem gemeinnützigen Poynter Institute for Media Studies, und der Chefredakteur und Geschäftsführer von PolitiFact ist dem Präsidenten von Poynter unterstellt. PolitiFact war im Besitz der Tampa Bay Times, aber im Jahr 2018 wurde das direkte Eigentum an PolitiFact von der Times auf Poynter, die Muttergesellschaft der Zeitung, übertragen. Der Schritt ermöglicht es PolitiFact, vollständig als gemeinnützige nationale Nachrichtenorganisation zu funktionieren.
Die Verbindungen zwischen dem Poynter Institute und der Tampa Bay Times reichen Jahrzehnte zurück. Der langjährige Eigentümer der Times war Nelson Poynter, dessen Vater die Zeitung 1912 gekauft hatte. Poynter setzte sich für unabhängigen Journalismus ein und wollte sicherstellen, dass die Zeitung in lokalem Besitz bleibt und vor Kettenbesitz geschützt bleibt. Deshalb hinterließ er die Zeitung nach seinem Tod im Jahr 1978 nicht seinen Erben, sondern der Journalistenschule, die heute seinen Namen trägt.
Nelson Poynter war auch der Gründer von Congressional Quarterly, einer Nachrichtenorganisation, die über den Kongress in Washington, D.C. berichtete und bis 2009 dem Poynter Institute gehörte. PolitiFact setzt nun die historische Verbindung des Poynter Institute zum politischen Journalismus in Washington fort.